تتحدد رؤية قسم المخطوطات في البحث عن الكنوز المعرفية لهذة المخطوطات واعادة تهيئتها ودراستها كونها تضم معلومات تاريخية قيمة ,تخص كل فئات المجتمع العراقي.وكونها تمثل ارثا تاريخيا مهما يفرض على عاتقها مهمة البحث عنها ودراستها واعادة تحليلها تاريخيا واجتماعيا.

ويضم القسم مجموعة قيمة من المخطوطات تم الحصول عليها من مختلف شرائح المجتمع والقسم بصدد دراستها واستخراج الكنوز المعرفية منها.

ويقوم القسم شهريا باعداد العديد من الندوات الفكرية والتوعوية للتعريف بهذه المخطوطات.